Rostlinstvo závisí na nadmořské výšce, pro nižší polohy jsou typické listnaté a smíšené lesy, směrem k vyšším polohám přibývají jehličnaté lesy, subalpínská a alpínská vegetace.
Alpy jsou oblastí se zvláštní květenou a faunou. Švýcaři si své přírodní bohatství velmi chrání, a tak je na celém území mnoho rezervací a chráněných oblastí (označeny vždy informačními tabulemi). V kantonu Graubünden pak leží velký Švýcarský národní park (Schweizer Nationalpark).